Chaque combat utilise un deck de 12 cartes. Les cartes peuvent infliger des dégâts, appliquer des boucliers, buff les alliés, invoquer des aides ou manipuler les statuts. Beaucoup de cartes ne peuvent être utilisées qu'un nombre limité de fois par combat, donc l'enchaînement compte plus que tout jouer immédiatement.
En gagnant de l'expérience, les héros débloquent la possibilité de jouer des cartes supplémentaires par tour (souvent en partant d'une et en montant vers quatre). Plus de cartes par tour fait tourner le deck plus vite et permet des combos, mais vous expose aussi plus tôt au tour ennemi si vous ne pouvez pas finir rapidement.
Les attaques touchent généralement sauf si elles sont atténuées. Boucliers et buffs aident, mais le timing défensif est crucial : quand un ennemi attaque, une brève icône apparaît — appuyez sur le bouton d'interaction (A sur Xbox) pour bloquer et réduire les dégâts. Les ennemis de fin de partie peuvent utiliser des attaques perçantes qui punissent les stratégies basées uniquement sur les boucliers.
Contrairement au premier jeu, vous récupérez de la vie après chaque victoire, donc les enchaînements de combats multiples restent gérables si votre deck est stable. Il n'y a pas de réglage de difficulté ; si les combats semblent brutaux, montez de niveau, retravaillez les decks, changez les badges ou modifiez votre trio.